沈昙庆，吴兴武康人，是侍中沈怀文的堂兄。父亲沈发，官至员外散骑侍郎，早死，吴兴太守王韶之为他撰写祭文。
沈昙庆最初被征用为主簿、本州从事、西曹主簿、长沙王刘义欣后军镇军主簿。遇到母亲去世，他悲痛万分，被人们所称述。县令诸葛阐之劝他节哀。沈昙庆守孝期满，再当主簿。刘义欣又请他当镇军记室参军。又出外当余杭县令，迁任司徒主簿、江夏王刘义恭的太尉录事参军、尚书右丞。当时每年都发生水灾和旱灾。昙庆打算设立常平仓库解救人民的疾苦，太祖采纳他的建议，但这事最终没有施行。他又兼领本郡中正职务、少府、扬州治中从事史、始兴王刘浚卫军长史，元凶刘邵杀文帝自立，世祖讨伐刘邵，刘邵派沈昙庆到东方招募兵士，安东将军随王刘诞把他逮捕到永兴县监狱，不久便被原谅释放。
世祖即位，任命沈昙庆为东海王刘礻韦的抚军长史，又进京当尚书吏部郎、江夏王刘义恭的大司马府长史、南东海太守、左卫将军。大明元年(457)，沈昙庆当督徐、兖二州和梁郡诸军事、辅国将军、徐州刺史。当时殿中员外将军裴景仁帮助镇守彭城，本来是北方来的流民，很熟悉北方事务。沈昙庆叫他撰述《秦记》十卷，叙述苻氏兴亡本末故事。这书在社会上流传。第二年沈昙庆再被征调为左卫将军，加官给事中，兼领本州大中正。三年(459)他迁任祠部尚书。当年去世，时年五十七岁。被追赠本来官职。沈昙庆谨慎、踏实、清正廉洁，在任上都有好声名。他常对儿子弟弟们说：“我处世也没什么才能，只管做大老儿子罢了。”世人认为他是一个胸怀宽厚的人。