穆崇，平城人。他的祖先在神元帝、桓帝、穆帝时效力于拓跋氏。穆崇机敏果断，善于逢迎，年少时以盗窃为业。太祖道武帝拓跋皀流落独孤部时，穆崇常常往来供给他生活的必需品，尽心尽力无人能比。后来刘显阴谋叛乱，平文帝拓跋郁律的外孙梁眷得知后，暗中派遣穆崇密报拓跋皀。梁眷对穆崇说：“刘显如果得知此事而拷问你，大丈夫当舍身取义，虽刀割剑剐，也不要泄露。”于是将爱妻及所乘良马托付给穆崇，说：“事情泄露，我就靠这来洗刷自己了。”穆崇将刘显的阴谋密报拓跋皀后，拓跋皀逃奔贺兰部，刘显果然怀疑是梁眷泄露了他的阴谋，打算囚禁梁眷。穆崇故意放风说：“梁眷不顾恩义，与刘显狼狈为奸，如今我抢了他的爱妻和宝马，足以雪恨。”刘显闻知，便不再怀疑梁眷。刘显迎立拓跋皀的叔父拓跋窟咄，向拓跋皀发难时，穆崇的外甥穆桓等人阴谋推翻拓跋皀与之里应外合，劝穆崇说：“如今拓跋窟咄已被迎立为王，众人纷纷归附，到手的富贵不可以失掉，愿舅父能与我们共图大事。”然而穆崇却将他们的阴谋连夜报告了拓跋皀。拓跋皀诛杀了穆桓等人，向北越过阴山，再次投奔贺兰部。穆崇因此日益受到拓跋皀的宠信。
拓跋皀为魏王时，拜穆崇为征虏将军。跟随拓跋皀平定中原后，被封为历阳公，任散骑常侍。后升任太尉，兼任侍中，迁封安邑公。后又跟随拓跋皀征讨高车诸部落，大胜而归。后秦皇帝姚兴围攻洛阳，东晋洛阳守将辛恭靖向北魏求救，拓跋皀派穆崇率六千骑兵赴援。援军未至，辛恭靖战败，拓跋皀下诏命穆崇镇守野王，任豫州刺史，统辖所率兵马。后又调回朝中任太尉，迁封宜都公。道武帝天赐三年(406)，穆崇逝世。先前，卫王拓跋仪谋反，穆崇曾参与其事，道武帝拓跋皀念及穆崇劳苦功高，替他隐瞒遮掩了过去。等到有关部门奏议穆崇的谥号，拓跋皀亲自查阅授予谥号的方法，看到称不能有始有终地坚守节义为“丁”，拓跋皀说：“这个就很恰当。”于是确定穆崇的谥号为“丁公”。
当初，拓跋皀躲避窟咄之难时，曾派穆崇回去访察民情。穆崇夜至民间，将坐骑留给随从，微服潜入营地。恰巧营地中生有篝火，借着火光被舂米的妇人认出，贼兵全被惊起。穆崇寻随从不到，只好躲藏在土坑中，等到机会才偷了匹马逃走。宿营于大泽岸边，遇到一只白狼向他嚎叫，穆崇顿时醒悟，骑马随白狼而去。刚刚离去，贼人追兵就已到达，于是幸免于难。道武帝拓跋皀十分惊异，命穆崇为白狼设立神位，子孙世代供奉。孝文帝太和年间，追封功臣，以穆崇的灵位配祭太庙。